Pitrufquén tiene 14 colegios privados registrados en el directorio del MINEDUC. De ellos, 9 ofrecen bachillerato completo hasta grado 11, mientras que 4 llegan solo hasta primaria. Otros 1 son exclusivamente jardines infantiles o preescolares. 13 son particulares subvencionados y 1 particulares pagados. 9 cobran pensión gratuita.