Mocoa tiene 10 colegios privados registrados ante el Ministerio de Educación Nacional. De ellos, 3 ofrecen bachillerato completo hasta grado 11, mientras que 3 llegan solo hasta primaria. Otros 4 son exclusivamente jardines infantiles o preescolares. 6 manejan jornada completa. 3 pertenecen a comunidades religiosas, fundaciones o cooperativas; el resto son de persona natural.