La Ceja tiene 13 colegios privados registrados ante el Ministerio de Educación Nacional. De ellos, 8 ofrecen bachillerato completo hasta grado 11, mientras que 2 llegan solo hasta primaria. Otros 3 son exclusivamente jardines infantiles o preescolares. 9 manejan jornada completa. 4 pertenecen a comunidades religiosas, fundaciones o cooperativas; el resto son de persona natural.