En La Ceja hay 8 colegios con primaria registrados ante el Ministerio de Educación Nacional. De ellos, 6 ofrecen bachillerato completo hasta grado 11, mientras que 2 llegan solo hasta primaria. 4 manejan jornada completa. 3 pertenecen a comunidades religiosas, fundaciones o cooperativas; el resto son de persona natural.